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简介：!（宠物小精灵最美好的祝愿），简称宠物小精灵神奇宝贝神奇宝贝超级愿望。是这个星球上非常不可思议的生物。现在开始讲述少年小智与宠物小精灵的邂逅、冒险和战斗经历的故事。和《神奇宝贝超世代》与《神奇宝贝钻石&;珍珠》类似，超级愿望篇也以小智与皮卡丘前往新地区开始。和过去的情况类似，在新的系列中，上一代的两位主角——小光和小刚，各自怀揣着新的梦想而和小智告别。小智在合众地方新的旅行同伴是神秘的少女艾莉丝和三曜道馆的训练家之一的天桐。同以前一样，在新的系列中，小智也新装登场。此外，合众地方的乔伊和君莎小姐的设计、造型也和前三部中的大不相同。另一处变更就是，在前三部神奇宝贝中心出现的雷打不动的护士神奇宝贝在本部中也不是吉利蛋或幸福蛋，而是合众图鉴中出现的新神奇宝贝差不多娃娃。另外本系列与前两部的一处大不同是，由于一起旅行的同伴不再是新人协调训练家（小遥和小光都是），因而剧情中基本不会再有前两部中分量颇重的华丽大赛剧情（但有名为“口袋音乐会”的类似华丽大赛的设施），这点和多年前没有华丽大赛时的神奇宝贝无印极为相似。